2007.12.21 不気味で薄暗い部屋…。 「服部平次…。」 「遠山和葉…。」 「毛利蘭…。」 「工藤新一…。」 「フッ…。」 鼻で少し笑うとその男は、写真にナイフを刺した…。

1997年3月に組織はなくなった。工藤新一、毛利蘭、服部平次、遠山和葉の4人は、東都大学法学部を卒業し、その後、警察官になり、その後すぐに、警視庁、大阪府警の刑事部に所属となったのだ。そして、10年後、2007年12月21日に、過去に例をみない事件が発生し、東京が大パニックに陥る。犯人からのメッセージ、暗号、不可解な事件現場の状況、そして警察上層部のしがらみにより、捜査は難航を極める。警察は、事件の真相を暴くことができるのか？